Uma das prioridades dos gestores do programas que fazem parte do projecto Portugal 2020 é acelerar a a execução dos programas comunitários. O foco actualmente está nas despesas de projectos que é necessário enviar para a Comissão Europeia para certificação. Esta vontade de acelerar o processo surgiu depois do ministro da tutela ter deixado claro que ou Portugal acelera e tenta aproximar o volume de despesas certificadas às metas de execução mínima que são impostos pelos regulamentos comunitários ou então será anulada a atribuição desses montantes.