Jacob (Asa Butterfield, o miúdo doHugo) é um adolescente deprimido a quem morre o avô (o incrível Terence Stamp) em circunstâncias misteriosas. Com pais que não lhe ligam nenhuma, era Abraham que o encantava com histórias sobre uma casa no País de Gales onde a Senhora Peregrine (Eva Green, sempre magnífica e o filme sofre nos seus períodos de ausência) cuidava das crianças peculiares - Emma, que é mais leve do que o ar e precisa usar sapatos de chumbo, ou Enoch, capaz de dar vida a objectos com a ajuda de pequenos corações. Ou seja, uma espécie de Escola do Professor Xavier mas para outras crianças.